湖南大學等單位成功揭示新冠病毒與SARS存在差異

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  近日,湖南大學聯合中國醫學科學院系統醫學中心蘇州系統醫學研究所、中國疾病預防控制中心,在國際權威期刊CellHost&Microbe在線發表題為“Genome Composition and Divergence of the Novel Coro navirus (2019-nCoV) Originating in China”的研究論文,揭示新型冠狀病毒(2019-nCoV)的基因組構成和蛋白序列水平與2003年爆發的SARS病毒之間存在差異。

  該論文共同第一作者為:蘇州系統醫學研究所吳愛平研究員、湖南大學生物學院彭友松副教授、中國疾控中心黃保英副研究員、蘇州系統醫學研究所丁嘯副研究員。

  該研究對2019-nCoV已確定的三個基因組和相關冠狀病毒的基因序列進行比較,其中包括1008條人SARS冠狀病毒序列、338條蝙蝠SARS樣冠狀病毒序列和3131條人中東呼吸綜合征(MERS)冠狀病毒序列,發現這三株2019-nCoV病毒的基因組序列幾乎相同(約29.8kb核苷酸的基因組中隻有5個核苷酸差異),與蝙蝠SARS樣冠狀病毒的關系比與人SARS冠狀病毒或人類MERS冠狀病毒更為相近。

  該研究發現,該新型冠狀病毒至少編碼27種蛋白質,其中包括15種非結構蛋白(nsp1到nsp10,nsp12到nsp16)、4種結構蛋白(S、E、M和N)和8種輔助蛋白(3a、3b、p6、7a、7b、8b、9b和orf14)。

  2019-nCoV與SARS-CoV雖相似,但在編碼的蛋白上存在一些顯著差異。例如,在SARS-CoV中存在8a蛋白,而在2019-nCoV中不存在;8b蛋白在SARS-CoV中有84個氨基酸,但在2019nCoV中更長,有121個氨基酸;3b蛋白在SARS-CoV中有154個氨基酸,在2019-nCoV中較短,隻有22個氨基酸。這些差異可能影響2019-nCoV的功能和發病機制,亟待進一步研究。

  研究者進一步分析發現在2019-nCoV與SARS和SARS樣病毒的氨基酸序列之間存在380個氨基酸的差異,比如在S蛋白上,2019-nCoV相對於SARS-CoV在直接與人類受體ACE2蛋白相互作用的受體結合基序中不存在氨基酸替換,但是RBD(受體結合區)的其他區域發生瞭6個氨基酸替換。這些氨基酸水平差異可能有助於揭示2019-nCoV與SARS病毒在傳染性和致病力上的潛在差異。